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2025-07-21

Python在生物医学数据处理中的应用:Pandas实战指南

Python在生物医学数据处理中的应用:Pandas实战指南
一、生物医学数据的特殊性挑战在哈佛医学院的实验室里,张博士正面临一个典型难题:从基因测序仪导出的2.7GB临床数据包含混乱的缺失值、非标准化的基因命名以及异构的时间序列记录。这正是生物医学数据的三大特征: 高维度性:单细胞RNA测序数据通常包含20000+基因特征 非结构化存储:实验室常用Excel混合存储数值、文本和图像索引 多源异构:电子病历(EMR)、DICOM影像、实验设备数据需要统一处理 python import pandas as pd from pathlib import Path典型生物医学数据加载示例def loadbiodata(filepath): if Path(filepath).suffix == '.xlsx': return pd.readexcel(filepath, sheetname=None) # 处理多sheet情况 elif Path(filepath).suffix == '.csv': return pd.readcsv(filepath, encoding='latin1') ...
2025年07月21日
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