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2025-07-20

huARdb:解码免疫组库与单细胞转录组的交叉对话

huARdb:解码免疫组库与单细胞转录组的交叉对话
huARdb作为首个整合单细胞转录组与免疫受体克隆型的人类抗原受体数据库,为免疫微环境研究提供了全新的多维度分析视角。本文深度解析其技术架构、应用场景及对精准免疫治疗的推动作用。免疫系统的复杂性在于其兼具分子层面的精准识别与细胞群体的动态协作。传统单细胞转录组虽能刻画细胞状态,却难以捕捉决定免疫特异性的关键——T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)的克隆特征。2023年诞生的huARdb数据库首次实现了单细胞分辨率下克隆型与转录组的协同分析,为免疫学研究开辟了新维度。一、技术突破:当VDJ测序遇上单细胞转录组huARdb的核心价值在于解决了三大技术痛点: 1. 数据异构性整合:通过自适应算法统一处理10x Genomics、Smart-seq2等不同平台产生的VDJ-转录组配对数据 2. 三维注释体系: - 克隆层面:TCRβ/BCR HCDR3序列相似性聚类 - 细胞层面:T/B细胞亚型标记基因表达 - 微环境层面:克隆扩增与细胞互作网络关联 3. 动态可视化引擎:支持克隆轨迹追踪(如图1所示),可直观展示特定克隆在免疫应答过程中的转录状态演变二、临床应用...
2025年07月20日
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